Undertale est un RPG oriental avec quelques aspects d'action dans son système de combat. Dans le monde extérieur, le joueur explore des zones, résout des énigmes et parle aux PNJ. Lorsqu'une bataille est déclenchée, généralement par rencontre aléatoire, le jeu passe à l'écran de combat. Un cœur représentant l'âme de l'enfant apparaît dans une petite boîte, dans laquelle apparaissent des objets représentant les attaques des monstres et qu'il faut esquiver en temps réel. Au tour de l'enfant, il peut attaquer les monstres plus directement grâce à la commande de combat. Un compteur qui détermine la force de l'attaque du joueur doit être touché au bon moment afin d'infliger plus de dégâts.
