Secret of Mana es un juego de rol de acción, que presenta combate estilo hack-and-slash en tiempo real, en el que pueden acompañarte hasta dos compañeros controlados por computadora. El protagonista tiene un indicador de resistencia: cuanta más resistencia tenga, más poderoso será su golpe. El jugador también tiene acceso a un creciente arsenal de hechizos con varios efectos. Es posible actualizar armas, armaduras y magia a niveles más altos.
