Clock Tower 3 est une aventure d'action et d'horreur de survie dans laquelle vous incarnez Alyssa, une fille qui approche de son 15e anniversaire. Elle est rappelée à la maison du pensionnat à cause d'une mystérieuse lettre de sa mère. Quand elle arrive, sa mère est partie et seul un inconnu effrayant est là pour l'accueillir. Alyssa est sur le point d'hériter d'un grand pouvoir, et le mystérieux inconnu, qui lui est étroitement lié mais garde d'abord son identité cachée, est là pour l'obtenir.
