Cette suite de la série Persona, qui fait partie de la franchise Megami Tensei, n'est pas directement liée à ses prédécesseurs au niveau de l'histoire. Le gameplay a également subi des changements importants, ajoutant un élément de « simulation scolaire » dans la formule Megaten RPG. Vous vivez la vie d'un lycéen normal : vous assistez aux cours, parlez à vos amis, faites vos devoirs, attendez les vacances d'été, etc. Le jeu est divisé en journées scolaires avec leur propre horaire.
